Nedavno,Sedmični izvještaj CDC-a za Kinuobjavio je važan istraživački članak koji opisuje epidemiološko i etiološko istraživanje akutne epidemije gastroenteritisa uzrokovane rotavirusom grupe C (RVC) u osnovnoj školi u Luzhouu, provincija Sečuan, u oktobru 2025. godine. Posebno je važno napomenuti da su Macro & Micro-Testov visokopropusni ciljani komplet za hvatanje patogena (hvatanje sondom) i tehnologija sekvenciranja obogaćivanja cijelog genoma odigrali ključnu ulogu u istraživanju. Omogućavajući tačnu identifikaciju patogena i sveobuhvatnu genomsku karakterizaciju, tehnologija je pružila ključne naučne dokaze za brzu potvrdu epidemije, precizno praćenje izvora i efikasnu kontrolu epidemije.
Iznenadna epidemija: Prva prijavljena epidemija RVC-a u jugozapadnoj Kini
Dana 15. oktobra 2025. godine, u osnovnoj školi u Luzhouu došlo je do akutne epidemije gastroenteritisa. Škola je imala ukupno 1.943 učenika i osoblja, sa prijavljenih 32 slučaja, uključujući 6 laboratorijski potvrđenih i 26 klinički dijagnosticiranih slučajeva, što je rezultiralo ukupnom stopom oboljenja od 1,65%. Epidemija je dostigla vrhunac između 15. i 16. oktobra, s najvećom stopom oboljenja (23,08%) u 7. i 5. razredu (23,08%). Većina pacijenata bila su djeca školskog uzrasta (srednja dob: 10 godina), a prvenstveno su se javljali sa povraćanjem (65,62%), dijarejom (46,87%) i bolovima u trbuhu (37,50%). Simptomi su obično trajali 1-3 dana, a svi pacijenti su se oporavili bez teških komplikacija.
Epidemiološka istraga identificirala je indeksni slučaj kao 11-godišnjeg dječaka u 7. razredu, 5. razredu. Njegova mlađa sestra razvila je slične simptome prije njega, što ukazuje na kućni prijenos kao početni izvor. Neadekvatno upravljanje povraćotinom na kampusu - uključujući direktno metenje i odlaganje bez pravovremene dezinfekcije ili izolacije područja - u kombinaciji s lošom higijenom ruku među učenicima, vjerovatno je olakšalo daljnji prijenos. Većina pogođenih učionica nalazila se između drugog i petog sprata i dijelila je susjedne muške toalete, što ukazuje na to da su i aerosolni i kontaktni prijenos mogli doprinijeti širenju.
Istraga je postala posebno izazovna jer su rutinski testovi na patogene, uključujući testove na norovirus i rotavirus grupe A, dali negativne rezultate, što ukazuje na to da je odgovoran neuobičajeni patogen.
Etiološka dijagnoza: Sekvenciranje cijelog genoma makro i mikro testom identificira krivca
Početno testiranje na norovirus bilo je negativno. CDC u Luzhouu je naknadno koristio multipleks PCR test u realnom vremenu za gastrointestinalne patogene, sposoban za simultano otkrivanje 28 patogena, uključujući 8 virusa, 17 bakterija i 3 parazita, kako bi se pregledalo osam kliničkih uzoraka. Dana 17. oktobra, šest uzoraka je bilo pozitivno na rotavirus grupe C, čime je uspješno identificiran uzročni patogen.
Kako bi dalje pratili izvor epidemije, istraživači su izvršili i nanopore metagenomsko sekvenciranje i Macro & Micro-Test sekvenciranje obogaćivanja cijelog genoma hvatanjem sonde na pet pozitivnih uzoraka. Ovaj pristup uspješno je generirao pet kompletnih RVC genomskih sekvenci (SC01–SC05). Integrirana strategija brzog multipleks PCR skrininga, nakon čega slijedi sekvenciranje cijelog genoma visoke rezolucije, pružila je snažnu tehničku podršku za tačnu molekularnu epidemiologiju i praćenje izvora.
Naučni uvidi: Prva identifikacija genotipa M2 u jugozapadnoj Kini
Na osnovu visokokvalitetnih podataka o cijelom genomu generiranih korištenjem Macro & Micro-Test tehnologije, istraživački tim je izvijestio o nekoliko važnih naučnih otkrića:
Potvrda monoklonske epidemije:Svih pet virusnih izolata dijelilo je identičan genotip cijelog genoma (G4-P[2]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2), sa samo 0-1 razlikama u polimorfizmu jednog nukleotida (SNP), što konačno pokazuje da je epidemija nastala iz jednog lanca prijenosa.
Otkriće M2 genotipa:Filogenetska analiza je otkrila da sojevi Luzhou RVC pripadaju genotipu M2, a ne genotipu M3 koji se ranije smatrao predominantnim među kineskim sojevima RVC. Ovo otkriće dovodi u pitanje konvencionalno razumijevanje distribucije genotipa RVC u Kini i potvrđuje pojavu genotipa M2 u jugozapadnoj Kini.
Dokaz o međunarodnim prenosnim vezama:Poređenje cijelog genoma pokazalo je visoku genetsku sličnost između sojeva Luzhou i sojeva RVC koji su prethodno zabilježeni u Yunnanu (2025), Novosibirsku, Rusija (2017) i Italiji (2012), što ukazuje na postojanje aktivne euroazijske transmisijske mreže.
Implikacije za prevenciju i kontrolu: Rano otkrivanje i brza intervencija su neophodni
Nakon identifikacije patogena, CDC Luzhou je odmah implementirao sveobuhvatne mjere kontrole, uključujući izolaciju slučajeva, dezinfekciju okoline, standardizirano upravljanje povraćkom i privremenu obustavu nastave. Pojava je uspješno suzbijena unutar jednog inkubacijskog perioda, bez prijavljenih dodatnih slučajeva nakon 21. oktobra.
Istraživanje također pruža važnu lekciju za javno zdravstvo: za klasterirane epidemije gastroenteritisa koje su negativne i na rotavirus grupe A i na norovirus, rotavirus grupe C i druge rotaviruse koji ne pripadaju grupi A treba uključiti u rutinske dijagnostičke preglede.
Ova studija predstavlja prvu prijavljenu epidemiju rotavirusa grupe C u jugozapadnoj Kini i prvu identifikaciju genotipa M2 u regiji, proširujući trenutno razumijevanje epidemiologije RVC-a u istočnoj Aziji. U ovom istraživanju, integrirano rješenje kompanije Macro & Micro-Test, koje kombinira multipleks PCR skrining sa sekvenciranjem obogaćivanja cijelog genoma, pokazalo je značajnu praktičnu vrijednost omogućavajući brzu identifikaciju patogena i molekularno praćenje izvora visoke rezolucije, pružajući reproducibilan tehnički okvir za precizno istraživanje i kontrolu budućih epidemija zaraznih bolesti.
Vrijeme objave: 30. juli 2026.