Višedržavni odgovor na klaster hantavirusa u Andima: NAAT i sekvenciranje cijelog genoma kao ključni alati

U aprilu 2026. godine, kruzer polarne ekspedicije pod holandskom zastavomMS Hondiuspoletio je iz Ushuaije u Argentini. Dana 6. aprila, jedan putnik je dobio groznicu i glavobolju, te je umro na brodu pet dana kasnije. Njegova supruga se također razboljela i umrla nakon što je prebačena u Južnu Afriku. Nakon toga, 69-godišnji britanski putnik je bio pozitivan na hantavirus i ostaje na intenzivnoj njezi. Zaključno sa 13. majem, Svjetska zdravstvena organizacija je izvijestila...11 slučajeva i 3 smrtna slučajapovezano s izbijanjem zaraze na brodu.

I. Pregled virusa i patogenih tipova

Hantavirusi su grupa RNA virusa koje uglavnom prenose glodari, a pripadaju rodu Orthohantavirus u porodici Bunyaviridae. Njihov genom se sastoji odtri segmenta (L, M i S), koji kodiraju RNK-zavisnu RNK polimerazu, glikoproteine ​​i nukleokapsidni protein, respektivno. Na osnovu geografske distribucije i kliničkih manifestacija, hantavirusi se klasifikuju udvije glavne grupe:

Hantavirusi Starog svijeta(nalazi se u Evropi, Aziji i Africi) uzrokHemoragijska groznica s bubrežnim sindromom (HFRS)Reprezentativni virusi uključuju Hantaan virus (HTNV), Seoul virus (SEOV) i Puumala virus (PUUV). Oni prvenstveno ciljaju bubrege, što dovodi do oštećenja bubrega, hemoragijskih manifestacija, a u teškim slučajevima i šoka. Stope smrtnosti variraju ovisno o vrsti virusa, ali se uglavnom kreću od<1% do 5-15%.

Hantavirusi Novog svijeta(cirkulira u Sjevernoj i Južnoj Americi) uzrokHantavirusni plućni sindrom (HPS)Reprezentativni virusi uključuju virus Sin Nombre (SNV) i virus Andes (ANDV). Oni prvenstveno ciljaju pluća, uzrokujući brzi nekardiogeni plućni edem, teške respiratorne tegobe i kardiovaskularne probleme. Početni simptomi su slični gripi (groznica, mialgija, gastrointestinalne tegobe), ali bolest može brzo napredovati do respiratorne insuficijencije, sastope smrtnosti dostižu 30-50%.

Pojavu zaraze na kruzerima uglavnom je uzrokovaloAndski virus (ANDV), koji pripadaHantavirusni plućni sindrom (HPS)podtip.

II. Tradicionalni hantavirusi povezani s HFRS-om u odnosu na virus Anda (HPS)

Tradicionalni visokofrekventni fluidni sistem (HFRS)

III. Načini prenošenja

Hantavirus se uglavnom prenosi putemdirektan kontakt sa izmetom, pljuvačkom ili urinom zaraženih glodaraili od straneudisanje aerosoliziranih izlučevinaDruge moguće rute uključuju:

- Ugriz ili ogrebotina zaraženih glodara;

- Konzumiranje hrane kontaminirane urinom, izmetom ili slinom zaraženih glodara;

- Dodirivanje očiju, nosa ili usta nakon kontakta sa kontaminiranim predmetima.

Prijenos s čovjeka na čovjeka je izuzetno rijedak, ali je potvrđeno zaAndski virus (ANDV).

IV. Globalno praćenje kontakata s hantavirusom – testiranje i sekvenciranje nukleinskih kiselina kao ključne tehnologije

Nakon izbijanja ANDV-a, zdravstvene vlasti u više od deset zemalja - uključujući Španiju, Ujedinjeno Kraljevstvo, Sjedinjene Američke Države, Kanadu i Švicarsku - istovremeno su pokrenule praćenje kontakata i praćenje karantina. Francuska, Sjedinjene Američke Države i druge zemlje nastavile su pratiti zdravstveno stanje svojih građana koji su se vratili sa pogođenog broda.

U ovom odgovoru na vanredne situacije u više zemalja,testiranje nukleinskih kiselina i genomsko sekvenciranjeodigrali su nezamjenjivu ključnu ulogu:

-Testiranje nukleinskih kiselinapruža konačne dokaze za brzu identifikaciju patogena;

-Genomsko sekvenciranjenudi nezamjenjive molekularne dokaze za praćenje izvora infekcije, potvrđivanje lanaca prenosa i procjenu virusnih promjena.

V. Rješenja za detekciju hantavirusa (posebno HPS tipa)

1. Rana identifikacija patogena

1.1 Testiranje na mjestu pružanja zdravstvene zaštite (POCT)
Precizan skrining i hitno testiranje –od uzorka do rezultata za 1 sat.
Dijagnostički izazovi i brza molekularna rješenja Testiranje na mjestu pružanja njege
1.2 Konvencionalna PCR
Konvencionalna PCR

2. Rješenja za sekvenciranje

Za identifikaciju patogena i praćenje izbijanja u slučajevimagroznica nepoznatog porijekla, respiratorni distres ili hemoragijske manifestacije.
hemoragijske manifestacije

Osnovne karakteristike:

Osnovne karakteristike

VI. Verifikovani podaci o performansama

Sekvenciranje cijelog genoma uzoraka pozitivnih na hantavirus zasnovano na snimanju sondom postignuto>99% pokrivenosti genoma na dubini od 30×.
Verifikovani podaci o performansama

Genotipizacija hantavirusa i analiza udjela podtipova na bazi otpadnih voda su izvodljivi.
proporcija podtipova

VII. Povezani setovi

Povezani setovi


Vrijeme objave: 14. maj 2026.