Prva analiza sljedivosti Brucella abortus zasnovana na cijelom genomu u provinciji Zhejiang – Bioinformatički tim iz Macro & Micro-Testa doprinosi zajedničkoj publikaciji

—— Zajednička studija koju su proveli CDC Zhejiang, Macro & Micro-Test i CDC Kine, objavljena u časopisu Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

Pregled studije

U maju 2026. godine, časopis Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (JCR Q1, IF ≈ 4.6) objavio je rad koji je vodio Centar za kontrolu i prevenciju bolesti provincije Zhejiang (Zhejiang CDC), a koautori su bili bioinformatički tim iz Beijing Macro & Micro-Test Bio-Tech Co., Ltd. i Nacionalni institut za kontrolu i prevenciju zaraznih bolesti (China CDC). Studija nosi naslov:
"Identifikacija i filogenetska analiza sedam sojeva Brucella abortus u Zhejiangu, Kina."
Brucella abortus

Ova studija predstavlja prvu sistematsku, filogenetsku analizu sljedivosti Brucella abortus (B. abortus) zasnovanu na cijelom genomu u provinciji Zhejiang, Kina. Tim je analizirao sedam izolata prikupljenih od 2015. do 2025. godine (četiri soja ljudskog porijekla i tri soja goveđeg porijekla iz Jinhua, Quzhou i Ningbo). Nalazi pružaju genomske dokaze o porijeklu i putevima prenošenja ove „sjeverne dominantne vrste“ u atipičnoj južnoj epidemijskoj regiji istočne Kine.

 

Pozadina i značaj

 

Bruceloza je zoonoza uzrokovana bakterijom iz roda Brucella. Brucella abortus prvenstveno inficira stoku, ali može uzrokovati bolest i kod ljudi. U Kini, bruceloza pokazuje značajne geografske varijacije: najveća incidencija javlja se u sjevernim provincijama (npr. Unutrašnja Mongolija, Shanxi, Heilongjiang). Nasuprot tome, u južnim provincijama, uključujući Zhejiang, historijski je dominirala Brucella melitensis, sa vrlo malo prijavljenih slučajeva B. abortus. Ova regionalna nejednakost čini genetsku karakterizaciju i praćenje izvora B. abortus u Zhejiangu ključnim prioritetom javnog zdravstva.

 

Metode i ključni nalazi

Istraživački tim je usvojio višestruku strategiju koja kombinuje molekularnu biologiju i bioinformatiku:

1.Identifikacija patogena i osnovna tipizacija

PCR analiza gena BCSP-31 i AMOS-PCR potvrdile su da svih sedam izolata pripadaju vrsti B. abortus.

Multilokusna sekvencijska tipizacija (MLST) zasnovana na devet kontrolnih gena otkrila je da svi izolati pripadaju tipu sekvence ST2, što ukazuje na visoku genetsku homogenost među sojevima B. abortus koji cirkuliraju u Zhejiangu.
Identifikacija patogena i osnovna tipizacija

2.Karakterizacija cijelog genoma

Sekvenciranje cijelog genoma provedeno je na platformi Illumina NovaSeq. Analiza prosječnog identiteta nukleotida (ANI) pokazala je da izolati iz Zhejianga imaju do 99,99% sličnosti s referentnim sojem B. abortus 544.

Pan-genomska analiza otkrila je visoko očuvanu populaciju: identificirano je 3.084 gena jezgra, zajedno sa samo 10 gena ljuske, a nisu detektovani geni mekog jezgra ili oblaka.

图片1

 

3.Profili gena virulencije i antimikrobne rezistencije

Predviđeno je ukupno 68 faktora povezanih s virulencijom, koji pokrivaju klasične puteve poput biosinteze LPS-a, sistema sekrecije T4SS-a i dvokomponentnog regulatornog sistema BvrR-BvrS. Značajno je da svim izolatima nedostaju adhezinski geni bmaA i btaF. Analiza gena otpornosti otkrila je samo gen mprF u CARD bazi podataka, bez identificiranih drugih determinanti otpornosti.

Virulencija4. Filogenetska rekonstrukcija i praćenje prenosa

Analiza jednonukleotidnog polimorfizma jezgrenog genoma (cgSNP) smjestila je izolate iz Zhejianga na specifičnu poziciju u globalnom filogenetskom stablu. Rezultati su pokazali da sojevi iz Zhejianga formiraju monofiletičku grupu zajedno sa sojevima iz Rusije, Mongolije i nekoliko sjevernih kineskih provincija (Ningxia, Heilongjiang, Unutrašnja Mongolija, Hebei, Gansu, Peking). Ova grupa se dalje dijeli na tri različite podklade (klade 1-3), što ukazuje na više nezavisnih događaja uvođenja.

Filogenetska rekonstrukcija

Zaključci i implikacije

 

Ova studija pruža prvi visoko precizni genomski skup podataka o B. abortus u provinciji Zhejiang i donosi nekoliko ključnih zaključaka:

 

  1. Clear genetska pozadina– Sojevi B. abortus koji cirkuliraju u Zhejiangu pripadaju ST2 grupi, genomski su visoko konzervirani i predstavljaju tipičnu liniju bruceloze goveda.

 

2. Evipovezanost međuregionalnog prijenosa– Filogenetska analiza ne podržava postojanje nezavisne endemske loze u Zhejiangu. Umjesto toga, podaci snažno ukazuju na to da ovi sojevi potiču iz sjeverne Kine i da mogu dijeliti zajedničku evolucijsku pozadinu sa sojevima iz Rusije i Mongolije. Prisustvo tri podklade implicira više odvojenih događaja uvođenja.

 

3. Implikacije za javno zdravlje– Nalazi naglašavaju vrijednost genomskog nadzora bruceloze čak i u tradicionalno neendemskim regijama poput Zhejianga. Iako je trenutni broj slučajeva nizak, alati visoke rezolucije poput cgSNP-a mogu efikasno pratiti izvor uvezenih epidemija i pružiti naučne dokaze za prekidanje lanaca prenosa povezanih s međuprovincijskim transportom stoke.

 

Ovaj rad ne samo da popunjava istraživačku prazninu u provinciji Zhejiang, već i pruža nove osnovne podatke za nadzor patogena i procjenu rizika od bruceloze u regiji delte rijeke Jangce.

 

Informacije o radu:
Yang, Y., Shi, X., Chen, J., Wang, L., Wu, Z., Yao, W., … & Wu, B. (2026). Identifikacija i filogenetska analiza sedam sojeva Brucella abortus u Zhejiangu, Kina. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 16, 1758965.

 

 


Vrijeme objave: 10. juni 2026.