Nedavna metagenomska studija otkrila je izuzetno raznolik spektar virusa i bakterija koje prenose glodari u provinciji Heilongjiang, uključujući Lassa virus, Amur virus, Salmonelu i Yersinia pestis.
U istraživanju je korištenoKomplet za obogaćivanje patogene RNK od Macro & Micro-Test, zasnovana na tehnologiji hvatanja sonde. Selektivnim uklanjanjem rRNA domaćina i drugih konzerviranih fragmenata domaćina, metoda je efikasno zadržala mikrobnu RNK, značajno poboljšavajući osjetljivost detekcije patogena. Ovaj korak obogaćivanja RNK patogena bio je ključan za postizanje visoke stope detekcije i pružio je snažnu tehničku podršku za nadzor patogena.
Glodavci: ključni rezervoari zoonoza
Glodari su vrstama najbogatija i široko rasprostranjena grupa sisara, koja obuhvata više od 2.000 vrsta širom svijeta i čini preko 40% svih vrsta sisara.
Pored svog ekološkog značaja, glodari služe kao glavni rezervoari i vektori brojnih zoonotskih patogena.Budući da se staništa glodara često preklapaju s ljudskim okruženjem - putem direktnih ugriza, kontakta s izmetom ili indirektnog prijenosa putem buha i grinja - patogeni koje sadrže predstavljaju stalnu prijetnju javnom zdravlju.
Značajno je da više od 70% novih zaraznih bolesti potiče od divljih životinja, pri čemu glodari predstavljaju jedan od najznačajnijih rezervoara virusa.
Pogranična regija Heilongjiang: Prva linija za nadzor patogena
Heilongjiang, pogranična provincija na sjeveroistoku Kine, posjeduje obilne ekološke resurse i graniči s više zemalja. Kombinacija bogate biološke raznolikosti i čestog prekograničnog kretanja stanovništva stvara povoljne uvjete za prijenos patogena.
Između juna i jula 2021. godine, istraživači su prikupili 67 divljih glodara iz grada Hengdaohezi, u gradu Mudanjiang. Uzorci su uključivali:
l 20Poluostrvo Apodemus
l 47Myodes rufocanus
Svi primjerci su uhvaćeni u stambenim područjima i okolnim poljoprivrednim zemljištima, što naglašava blisku vezu između ljudskih naselja i staništa divljih životinja.
Tehnologija obogaćivanja patogena: Savladavanje pozadinskih smetnji domaćina
U metagenomskom sekvenciranju, RNK domaćina obično dominira očitavanjima sekvenciranja, maskirajući signale patogena male količine.
Da bi se riješio ovaj izazov, studija je koristilaKomplet za detekciju metagenomskih patogena kompanije Macro & Micro-Test. Koristeći tehnologiju hvatanja sondi, specifično dizajnirane sonde se vežu za rRNA domaćina i konzervirane sekvence, omogućavajući njihovo iscrpljivanje i time obogaćujući mikrobnu RNK.
Ovaj pristup je značajno poboljšao osjetljivost detekcije patogena, omogućavajući sekvenciranje nakon sekvenciranja da dobije veći udio očitanja patogena. Korak obogaćivanja postavio je čvrstu osnovu za preciznu karakterizaciju spektra patogena koje prenose glodari.
Nakon obogaćivanja, uzorci RNK su podvrgnuti reverznoj transkripciji, konstrukciji biblioteke i sekvenciranju visokog protoka. Bioinformatička analiza je uključivala:
Filtriranje genoma domaćina
Taksonomska klasifikacija korištenjem Kraken2
Korekcija brojnosti pomoću Brackena
Ovaj tijek rada generirao je sveobuhvatan profil virusnih i bakterijskih zajednica.
Nalazi istraživanja: Ko-cirkulacija više virusa i bakterija
Virusni nalazi
Detektovani virusi pripadali su 21 virusnoj porodici, uključujućiArenaviridaeiHantaviridae.
Krozde novoSastavljanjem pomoću Megahita, generirano je 154 virusna kontiga, od kojih je 110 usklađeno sa 19 virusa iz osam porodica.
In Poluostrvo Apodemus, identifikovani su sljedeći virusi:
l Arenavirusi: Lassa virus, Wenzhou virus, Gairo virus
l Hantavirusi: Amur virus, Puumala virus
In Myodes rufocanusDetektovani su pacovski arterivirus i amurski virus.
Među ovim patogenima:
Virus Lassa je uzročnik virusne hemoragijske groznice, sa stopom smrtnosti koja dostiže približno 20%.
Amur virus je jedan od patogena odgovornih za hemoragijsku groznicu s bubrežnim sindromom (HFRS). Kina prijavljuje najveći globalni teret infekcija hantavirusom.
Bakterijski nalazi
Ukupno je označeno 1.051 bakterijskih rodova.
Najbrojniji rodovi bili su:
lSalmonela(26–31%)
lJersinija(11–23%)
Salmonelaje glavni patogen koji se prenosi hranom, odgovoran za procijenjenih 9 miliona slučajeva tifusa i približno 110.000 smrtnih slučajeva godišnje širom svijeta.
Yersinia pestis, uzročnik kuge, odgovoran je za tri historijske pandemije. Provincija Heilongjiang prepoznata je kao jedno od prirodnih žarišta kuge u Kini i ostaje prioritetna regija za nadzor kuge.
Značaj studije
Naučni doprinosi
Ova studija predstavlja prvo izvješće o fragmentima virusa Lassa i virusu arteritisa pacova kod glodara iz Heilongjianga, proširujući kinesku bazu podataka o patogenima koje prenose glodari.
Sistematski karakterizira virusne i bakterijske zajednice u lokalnim populacijama glodara, pružajući osnovne podatke za nadzor zoonoza u pograničnim regijama.
Implikacije za javno zdravlje
Nalazi naglašavaju potrebu za kontinuiranim nadzorom i skriningom patogenaA. peninsulaeiM. rufocanus.
Podaci pružaju naučne dokaze koji podržavaju strategije kontrole izvora za bolesti poput kuge i hemoragijske groznice s bubrežnim sindromom.
Metodološke prednosti
Metagenomsko sekvenciranje omogućava nepristrasnu detekciju i poznatih i novih patogena.
U ovoj studiji, Macro & Micro-Testova tehnologija obogaćivanja patogena pokazala je snažne performanse, efikasno poboljšavajući detekciju ciljnih patogena u složenim biološkim uzorcima. Rezultati potvrđuju njenu sposobnost da podrži visokoosjetljivu identifikaciju patogena u nadzoru divljih životinja.
Preporuka proizvoda
Na osnovu uspješne primjene u ovoj studiji, komplet za obogaćivanje makro i mikro testova patogene RNA se toplo preporučuje za istraživanja metagenomskog nadzora.
Efikasnim smanjenjem nukleinskih kiselina domaćina i obogaćivanjem mikrobnih sekvenci, komplet značajno poboljšava osjetljivost detekcije i kvalitet podataka. Predstavlja ključni alat za precizno otkrivanje patogena u složenim uzorcima i pruža snažnu tehničku podršku za nadzor javnog zdravlja, procjenu rizika od zoonoza i spremnost za izbijanje epidemija.
Contact to learn more: marketing@mmtest.com
Vrijeme objave: 02.03.2026.