Nedavna studija objavljena uMikrobiomproveli su metagenomsku analizu virusa na 846 divljih malih sisara - uključujući šišmiše, glodare i rovke - prikupljenih u Sijera Leoneu, Zapadna Afrika. Studija je identificirala ukupno 39 RNA virusa povezanih sa sisarima, uključujući 26 novih i 13 ranije poznatih virusa. Među njima, porodica Paramyxoviridae pokazala je najveću raznolikost, dok su glodari sadržavali najveći broj virusnih vrsta (n = 26).
Procjena zoonotičkog rizika otkrila je tri poznata zoonotička virusa - virus encefalomiokarditisa, virus Lassa i Rocahepevirus sp. - kao i tri virusa s potencijalnim rizikom od prelijevanja: Melian virus, virus hepatitisa glodara i Hunnivirus A. Značajno je da je među novo identificiranim virusima, Batledantevirus 2 pokazao najsličniju filogenetsku vezu s virusom Le Dantec koji zarazi ljude. Serološka analiza je dodatno otkrila neutralizirajuća antitijela protiv ovog virusa kod 2,8% lokalnih stanovnika, što ukazuje na prethodnu, vjerovatno neotkrivenu, izloženost ljudi.
Ovi nalazi ističu prisustvo značajnog rezervoara virusa u Zapadnoj Africi, kojim dominiraju glodari, i podcrtavaju kritičnu važnost integriranih strategija nadzora na relaciji čovjek-životinja. Kombinacija metagenomskog skrininga sa serološkom validacijom pruža robustan okvir za identifikaciju virusa sa zoonotskim i potencijalnim prelivanjem.
Tokom protekle decenije, više od 60% novih zaraznih bolesti kod ljudi potiče od životinjskih rezervoara, pri čemu su šišmiši, glodari i rovke prepoznati kao ključni domaćini zoonotskih virusa. Afrika se široko smatra žarištem zoonotskih bolesti. Na primjer, Sijera Leone je prijavila preko 28.000 slučajeva tokom epidemije ebole 2014-2016.
Uprkos značajnom opterećenju zoonotskim bolestima u ovoj regiji, raznolikost i distribucija virusa kod divljih malih sisara ostaju nedovoljno okarakterisane. Kako bi se riješio ovaj nedostatak, istraživači su proveli sistematsku analizu viroma 846 divljih malih sisara uhvaćenih na tri lokacije u Sijera Leoneu između 2018. i 2023. godine. Studija je imala za cilj da okarakteriše virusnu raznolikost, identifikuje kandidate sa potencijalom za prenos između vrsta, procijeni rizik od zoonoza i generiše dokaze koji podržavaju sisteme ranog upozoravanja na nove zarazne bolesti.
Osnovne metode
Studija je primijenila sveobuhvatni tijek rada virusne metagenomike:
- Obrada uzorka:Tkiva srca, jetre, slezene, pluća i bubrega su prikupljena, objedinjena, homogenizirana i podvrgnuta ekstrakciji ukupne RNK.
- Sekvenciranje i sastavljanje:Prije konstrukcije biblioteke izvršeno je smanjenje količine ribosomske RNK, nakon čega je uslijedilo sekvenciranje visokog protoka korištenjem platforme Illumina NovaSeq 6000. Virusni kontigi su sastavljeni de novo.
- Identifikacija virusa:Virusi su identificirani na osnovu poravnanja gena RNK-zavisne RNK polimeraze (RdRp). Zadržani su samo virusi povezani s kičmenjacima, isključujući bakterijske, gljivične i biljne viruse.
- Bioinformatička analiza:Provedene su filogenetska rekonstrukcija, analiza rekombinacije, modeliranje međuvrsne mreže prijenosa i procjena rizika od zoonoza.
- Serološka validacija:Za Batledantevirus 2 razvijen je test neutralizacije pseudovirusa zasnovan na VSV-u. Neutralizirajuća antitijela otkrivena su u 2,8% ljudskih seruma, što pruža dokaze o potencijalnom zoonotičkom prijenosu.
StudijaRezultati
1. Otkriće i raznolikost virusa
Ova studija je provela transkriptomsku analizu sekvenciranja na 846 divljih životinja prikupljenih u Sijera Leoneu, uključujući glodare, šišmiše i rovke. Na osnovu kompletnih sekvenci gena RNK-zavisne RNK polimeraze (RdRp), identifikovano je ukupno 39 RNK virusa povezanih sa sisarima, uključujući 13 ranije poznatih virusa i 26 novih virusa.
Što se tiče virusnog sastava, porodica Paramyxoviridae pokazala je najveći nivo raznolikosti u sva tri reda domaćina, a slijede je Astroviridae i Picornaviridae. Što se tiče distribucije domaćina, glodari su doprinijeli najvećoj virusnoj raznolikosti, sa ukupno 26 virusnih vrsta, što ukazuje na njihovu istaknutu ulogu kao rezervoara virusne raznolikosti u regiji.
2. Zoonotski rizik
Procjena zoonotičkog rizika identificirala je tri poznata zoonotička virusa: virus encefalomiokarditisa, virus Lassa i vrste Rocahepevirus. Osim toga, tri virusa - Melian virus, virus hepatitisa glodara i Hunnivirus A - identificirani su kao potencijalni rizik od prelijevanja.
Među 26 novootkrivenih virusa, za četiri je predviđen visok zoonotski potencijal na osnovu filogenetskih i genomskih karakteristika. Posebno je važno napomenuti da je Batledantevirus 2 pokazao najsličniju filogenetsku vezu s poznatim virusom Le Dantec koji zarazuje ljude.
Naknadna serološka istraživanja dodatno su potvrdila ovaj nalaz, jer su neutralizirajuća antitijela protiv Batledantevirusa 2 otkrivena u 2,8% seruma lokalnog stanovništva. Ovaj rezultat sugerira da su se neprepoznate ili asimptomatske infekcije možda već dogodile unutar ljudske populacije, što ističe potencijalni, ali prethodno neotkriveni put prenosa zoonoze.
3. Dinamika međuvrstnog prijenosa
Analiza međuvrsnog prijenosa pokazala je da glodari zauzimaju centralnu poziciju unutar mreže dijeljenja virusa, djelujući kao ključni čvorovi koji olakšavaju razmjenu virusa između vrsta domaćina. Ukupno 15 virusa identificirano je kao virusi koji imaju potencijal za međuvrsni prijenos.
Dalja analiza obrazaca unakrsnog prijenosa virusa pokazala je da se dijeljenje virusa češće događa među domaćinima unutar istog taksonomskog reda, što ukazuje na to da povezanost domaćina igra važnu ulogu u dinamici prijenosa. Nasuprot tome, šišmiši su pokazali relativno niži kapacitet za unakrsni prijenos virusa.
Važno je napomenuti da su kod određenih virusa uočeni dokazi o širenju raspona domaćina. Na primjer, Melian virus, koji se ranije smatrao specifičnim za rovke, u ovoj studiji je također otkriven kod glodara, što ukazuje na potencijalnu promjenu u prilagodljivosti domaćina i povećan rizik od šireg prenošenja.
Zaključci i implikacije za javno zdravlje
- Visoka raznolikost viroma kod malih divljih sisara:Otkriće 39 RNA virusa, uključujući 26 novih vrsta, otkriva veliki rezervoar virusa u regiji i prvi put izvještava o novim virusima s visokim zoonotičkim potencijalom (npr. Batledantevirus 2).
- Glodavci kao prioritetne mete nadzora:Glodavci djeluju kao ključna središta za prijenos virusa i nose najveću virusnu raznolikost, što predstavlja najveći rizik od širenja.
- Potreba za integriranim strategijama nadzora:Nalazi podržavaju davanje prioriteta glodarima u programima aktivnog nadzora i primjenu integriranih pristupa koji kombiniraju metagenomiku, serologiju i ekološki monitoring na dodirnim točkama između čovjeka i divljih životinja.
Sveukupno, ova studija pruža ključne dokaze koji podržavaju sisteme ranog upozoravanja i okvire za procjenu rizika za nove zoonoze, naglašavajući važnost proaktivnog nadzora u regijama visokog rizika.
Informacije o proizvodu
Vrijeme objave: 23. mart 2026.